【衡道丨干货】常用肿瘤相关数据库（非常详细，非常全面）_这里写一个有创意和深度的标题

本文转载自基因谷
癌症是一种顽固的疾病，常用的治疗方法之一是传统化疗，但是它会对全身造成伤害，导致一些不必要的副作用，比如脱发，恶心和疲劳。
靶向治疗是一种更精准的方法，它只针对癌细胞进行杀伤，而不会损害正常的组织。靶向药物的研发将是治疗癌症的重要途径。
肿瘤的生物信息学数据库是肿瘤基础研究的发展、临床治疗水平的提高的重要工具。
综合性肿瘤数据库
The Cancer Genome Atlas (TCGA)TCGA是由美国国立癌症研究所（NCI）和国家人类基因组研究所资助的项目，旨在揭示癌症的发生和发展的分子变异图谱。该数据库主要对样本进行外显子组和基因组测序分析，所提供的数据包括：基因组拷贝数变化、表观遗传、基因表达谱、miRNA等。
InternationalCancer Genome Consortium (ICGC)ICGC的目标是获得包括胆道癌、膀胱癌、血癌等多达50种肿瘤及其亚型的基因组、转录组和表观遗传的完整信息。这些数据可推动癌症的机制和治疗的研究。
Catalogue of Somatic Mutations inCancer (COSMIC)COSMIC是世界上最大最全面的关于肿瘤的体细胞突变及其影响的资源库。它主要提供多种肿瘤细胞基因组中的CNA、甲基化、基因融合、SNP及基因表达等信息，这些突变信息是从科学文献中人工整理的。主页面分为项目、数据管理、工具、帮助、搜索框等几个部分，清晰明了。
cBioPortal for Cancer Genomics(cBioPortal)cBioPortal是一个癌症基因组数据的探索、可视化及分析平台，可用于多个癌症基因组学数据集的交互式探索。
该数据库可提供CNA、基因突变信息。针对每个基因，它可给出多个信息，主要包括：基因的CNA信息、基因突变在样本中的分布、突变位点和频率、共表达基因以及生存曲线等。
对于用户提供的基因列表，还可生成互作网络并提供已知的相互作用的药物。在发现肿瘤相关突变、分析基因的生物学功能以及药物选择等方面的研究中具有重要促进作用。
UCSC Cancer Genomics Browser UCSC Cancer Genomics Browser是一个可以对癌症基因组学和临床数据进行整合、可视化、分析的网络分析工具。
它保存癌症基因组及临床数据并收集了样本的多种信息，包括基因表达水平、CNA、通路信息等。在UCSC的癌症基因组浏览器中，可实现不同样本以及癌症类型之间的比较，分析基因组变异与表型之间的关联。
用户可以通过它浏览基因组的任何一部分，并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息，如已知基因、预测基因、表达序列标签、mRNA、CpG岛，克隆组装间隙和重叠、染色体带型、小鼠同源性等。
canEvolve 存储的信息包括：基因、microRNA (miRNA)和蛋白质表达谱、多种癌症类型的拷贝数变化(CNAs)以及蛋白质-蛋白质相互作用信息。
Cancer Genome Anatomy Project(CGAP) CGAP主要提供了cDNA克隆、文库、基因表达、SNP以及基因组变异等信息。CGAP收集的数据包括正常组织、前癌组织以及癌症组织的数据。